Дерево Дружбы растет на территории цитрусового сада Всероссийского института цветоводства и субтропических культур. В 1934 году ученый института Ф. М. Зорин для получения новых морозостойких сортов цитрусовых посадил в саду деревце дикого лимона. В его крону последовательно привил японские мандарины, испанские апельсины, китайские кинканы, итальянские лимоны, грепфруты и др. всего около 50 видов и сортов цитрусовых. В 1940 году на этом дереве в память о своем посещении сада сделал прививку известный полярный исследователь О. Ю. Шмидт. В 1957 году три вьетнамским врача предложили назвать это уникальное дерево — сад деревом Дружбы. К настоящему времени на нем растут ветки, привитые представителями 167 стран мира. Всего на нем сделано более 630 прививок. Они сделаны руками глав многих государств, видных общественных и политических деятелей, космонавтов, ученых и представителей культуры. Рядом с деревом Дружбы растет еще 60 молодых деревьев. Их посадили своими руками люди разных профессий из разных стран.

В саду растут деревья из США, Польши, Канады, Японии и других стран.

В 1981 г. по инициативе Л. М. Дмитриенко, продолжателя дела Ф. М. Зорина, в саду открылся музей (архитекторы Е. И. Боркалов, А. И. Савельев). Экспонатами его стали подарки «Дереву Дружбы» людей разных стран мира. Это национальные сувениры, письма, фото, реликвии, различные музыкальные инструменты, монеты, значки, шкатулки с землей с памятных и исторических мест. Всего в музее хранится свыше 20 тысяч подарков со всех континентов планеты.